No ASP.NET 2.0, podemos definir o Theme de uma aplicação web através do arquivo de configuração web.config. O código abaixo, que deve ser colocado dentro da seção <system.web> do web.config, demonstra como isso pode ser feito:
<pages theme="MeuTema" />
Para saber mais sobre Themes do ASP.NET 2.0, leia meus artigos sobre o assunto.
Ricardo Oneda